筛查是有风险的。
做出筛查的决定是很困难的。不是所有的筛查都有益， 其中大部分是有风险的。在进行任何癌症筛查前，你可能想要和医生讨论一下筛查内容。了解筛查的风险及该检查是否能够降低死于癌症的风险是非常重要的。
我国的大量科学证据表明，上消化道内镜检查是食管癌筛查的有效手段，而且内镜检查对于食管鳞癌的检出效果优于食管腺癌。因此，上消化道内镜检查是预防食管癌发生的有效方法。
食管癌筛查的风险包括：
检出食管癌不一定能够改善健康状况或者帮助患者延长生命。
如果你患有晚期食管癌或者癌细胞已经扩散至身体其他部位时，筛查不一定能够改善你的健康状况或者帮助你延长生命。
有一些癌症不会引发症状或者危及生命，但是如果在筛查时发现癌症，这些癌症可能会得到治疗。比起不治疗，治疗是否能够帮助你延长生命也是未知的，而且治疗癌症可能会有严重的副作用。
假阴性检测结果是有可能存在的。
即使已经患有食管癌，筛查结果也可能显示正常。即使有症状，但检测结果为假阴性（实际上有癌症,但检查结果提示正常即没有癌症）的人，也可能延误就医。
假阳性检测结果是有可能存在的。
即使没患癌症，筛查结果也可能会显示异常。假阳性检测结果（实际上没有癌症,但检查结果提示有癌症）会导致焦虑，随后通常会进行更多的检测（如活检），这也有风险。
检测本身也可能产生副作用。
食管镜检查和活检可能会产生罕见却严重的副作用。这些副作用包括：
