有关饮食与肝脏以外其他消化系统肿瘤的相关性研究已有很多，但是对饮食习惯及营养摄入在HCC发生中的影响的研究还很少，目前尚无确定的营养因素在HCC形成中起作用，仅仅是发现了一些可能因素，确切结论都还有待进一步证实。
例如，对酗酒者以及HBV感染者的研究发现，vit-A和血清胡萝卜素水平与HCC发生呈负相关，vit-A及其衍生物缺乏可能增加HCC的发生。
另有研究发现，叶酸缺乏与HCC发生相关，这在动物模型中得到了初步证实。叶酸是腺苷蛋氨酸（S-adenosylmefhionine：SAM）的代谢产物，在DNA甲基化中作为甲基的供体，而DNA甲基化是基因表达过程中的重要调控手段，甲基腺苷蛋氨酸转移酶，是肝细胞内的酶，在酒精性肝硬化中的活性下降，从而导致合成SAM的下降，在实验性（动物）模型中，SAM的缺乏导致DNA甲基化减少，稳定性下降，从而增加HCC发生的危险。叶酸的缺乏可能降低肝细胞内SAM水平，引起DNA去甲基化，在DNA肿瘤基因过度表达的前期研究也的确发现在HCC患者中总体的低甲基化水平，肿瘤抑癌基因相关DNA则存在过度甲基化。
必需脂肪酸（essential fatty acid，EFA）在复杂的机体代谢过程中起到非常重要的作用。多不饱和脂肪酸（poly-unsaturated fatty acids，PUFA）包含多种分子类型，在胰岛素抵抗和代谢综合征发生过程中，其各种分子类型的绝对数量和比例会发生显著性改变，这些数量、比例的改变可能是代谢性因素促进肿瘤发生的重要环节，并可能成为肿瘤相关复杂代谢中最重要的潜在靶位，脂肪酸成分的改变可能影响到细胞结构与功能。研究者通过对不同饮食的评价，发现了不同脂肪酸成分与HCC的相关关系，但是未获得一致的结论。
反之，也有研究提出了可能保护肝脏甚至预防HCC发生的饮食习惯，例如大量进食蔬菜和长期饮用咖啡。
代谢因素与HCC
近期研究表明，肥胖、糖尿病及代谢综合征均可促进HCC的发生。目前，超重是一个主要的世界性公共卫生问题，并常与代谢综合征紧密关联。超重者常导致以下指标的异常，例如动脉血压升高、高甘油三脂、低高密度脂蛋白、胰岛素抵抗（伴有或不伴有糖尿病代谢综合征），如有三项指标异常常常导致非酒精性脂肪性肝炎及相关肝硬化。超重及糖尿病同样增加丙型肝炎和酒精性肝病患者的肝硬化危险。
在男性，肥胖增加了HCC、胰腺癌、大肠癌和其他胃肠道肿瘤的发生风险；在女性，除有与上述男性相同的肿瘤发生高风险外，肥胖也同时增加了妇科肿瘤的发生风险。已有明确的研究数据显示，肥胖症肝硬化患者中HCC发生明显升高，糖尿病合并肝硬化患者HCC发生率升高。
肥胖与肿瘤发生机制尚不清楚，但可能与肥胖导致的代谢失调相关。胰岛素及胰岛素样生长因子1（insulin like growth factor-1，ZG-1）在肥胖人群的水平升高，并刺激正常细胞和肿瘤细胞的生长。血清中瘦素是脂肪组织分泌的脂肪因子的主要成分之一，流行病学研究发现瘦素可能与乳腺癌、子宫内膜癌、前列腺癌、大肠癌和胰腺癌发生相关。细胞培养显示，瘦素通过细胞膜特殊受体促进细胞生长可以刺激机体分泌MMP-2并增强MMP-6活性，MMP-6和MMP-2均为代谢相关调节的因子，在肿瘤的发生和代谢紊乱中发挥重要作用。另外，许多肥胖患者的促血管生成因子水平增加，大部分是基于瘦素调控下的过度分泌，而部分则是直接由脂肪组织分泌，促血管生成因子的增加进而会刺激肿瘤细胞的形成。
