常见的良性食管疾病有，平滑肌瘤、息肉、脂肪瘤、乳头状瘤、贲门失弛缓症、反流性食管炎等，其中多数与恶性食管癌并无关联。
但有一种特殊的食管炎——反流性食管炎，如果长期不积极治疗，可能导致一种被称为巴雷特食管 (Barrett’s esophagus, BE) 的并发症，巴雷特食管与食管癌有一定的关联。
胃食管反流病
胃食管反流病 (gastroesophageal reflux disease, GERD)，是指含胃酸的胃内容物反流至食管，导致的食管黏膜损伤和慢性炎症。如果在这一过程中出现食管黏膜损伤，则称之为反流性食管炎。男女均可发病，以中老年人多见。
反流性食管炎与食管下段括约肌功能障碍、进食过饱、吸烟、餐后平卧等有关。患者最常见的症状是反酸和胸骨后烧灼感，俗称“烧心”。
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Barrett 食管
胃食管反流病可能导致食管结构发生一种特殊变化——食管内壁黏膜正常的“鳞状上皮”变成了“柱状上皮”，而这种柱状上皮原本存在于胃黏膜表面，这种情况叫作“巴雷特食管”（Barrett 食管）。
研究表明，约 10% 的 Barrett 食管患者，可能发展为食管癌 ，通常是食管的腺癌。而 Barrett 食管患者发生腺癌的风险较正常人群高 20 倍。
需要说明的是，Barrett 食管在欧美国家高发，中国人的患病率比较低，约为 0.06%~1%。男性、体重超重等因素，会增加 Barrett 食管进展为食管腺癌的风险。